雲林縣長張麗善砲轟農委會淪為民進黨立委的輔選工具，所有農業補助好像都為綠委而開，陳吉仲回應，農業不分藍綠，不受政治影響。
張麗善指出，農委會的收購政策，透過特定立委，像西螺果菜市場改善案，縣府要求補助一直沒下文，陳吉仲和民進黨立委劉建國去了一趟西螺，馬上就宣布給1.5億，縣府所收到的還是「副本」，讓縣府成了農委會的絕緣體。
面對指控，陳吉仲堅稱農業沒有分藍綠、也不受政治影響，還舉例宜蘭辦綠博、台中的花燈節、南投的農業博覽會等，都是藍營執政縣市的農業活動。外界可以去檢視農委會過去舉辦的活動，或地方政府政策的配合情況。
除了張麗善之外，國民黨立委也對陳吉仲的偏心指證歷歷，立委馬文君就質疑她和許淑華提給農委會的建議，幾乎都沒下文，但陳吉仲的好友蔡培慧關注的案子，農委會馬上處理，錢給得很快，陳吉仲根本是公然把國家資源，當作給蔡培慧參選南投縣長選舉的輔選工具。
