太魯閣出軌事故發生後，雖然此次意外主要是因台鐵委外工程車滑落邊坡造成悲劇，但台鐵內部組織又遭檢討，以公司化、民營化方式來改革的可行性再度引起討論，以下列出贊成與反對的不同意見。
【贊成意見】交通部次長王國材王國材認為，公司化後不一定傷害員工，福利等事項都可談，組織改造是讓台鐵脫胎換骨的機會；但他也不諱言表示，台鐵同仁的確有很多擔心的地方，會再跟員工溝通。另外，王國材提到，公司化後用人、支出都可從董事會處理，中華郵政股份有限公司及台灣港務股份有限公司，兩者公司化後，現在也沒有員工說不好。
交通部次長 王國材前立法委員蔡煌瑯
身為中華軌道車輛工業發展協會理事長的蔡煌瑯覺得，應該認真思考台鐵公司化，讓台鐵局從組織體質及營運徹底脫胎換骨，讓新的台灣鐵路公司有更活化的經營策略，也要拋開沉重的歷史包袱，並加入資本市場靈活的營運效率，未來並開放民營鐵路公司競爭，或許這才是對台鐵最好的未來。
民進黨立委許智傑「台鐵最大問題是人事觀念的老舊」，許智傑說，不管誰當局長、誰當部長，都無法解決這個問題，除非將台鐵民營化。台灣寧可花大錢做建設，卻沒有魄力解決台鐵老舊車輛維護保養和人力短缺的問題，舊系統、舊觀念、舊包袱，有時候無法從根解決問題。有些「爛褥瘡」長在內部，破壞台鐵組織與安全文化，但難以察覺，必須徹底翻轉，才能減少災害發生。
行政院政務委員張景森張景森在臉書發文表示，贊同台鐵以「公司化」改革，但公司化非「民營化」更非「私有化」，中華電信、中華郵政就是改制公司的成功例子。而台鐵公司化最大阻力是員工，但其實中華電信、中華郵政公司化後，員工待遇福利只有增加，沒有減少。他相信只要跟員工、工會好好溝通，政府出面為員工保證，台鐵員工實在沒有理由需要擔心權益受損。不過票價調整需克服政治壓力，仍須說服大眾。（目前該則貼文已刪除）
【反對意見】台灣鐵路產業工會工會發聲明表示，反對公司化打假球的立場不變，台鐵改革不是一句「公司化」就可以解決，堅決反對換湯不換藥的假公司化議題，將採取行動以表反對態度。
台鐵產業工會理事長 王傑工會指出，這時候拋出公司化議題，其實對員工是很大打擊，現在人力、待遇都很糟，是不是覺得公司化可以解決一切問題呢？國家若沒辦法認真經營國營企業，公司化真的會好嗎？看到郵局、中華電信等公司化後，待遇更加低落、人才流失嚴重，這是政府要面對的狀況。
工會質疑，公司化以營利為目的，更加緊縮軟、硬體投資及人力，使台鐵更加陷入經營困難，最後必須變賣土地維持經營，不禁令人聯想，這是不是財團最終的目的？
旅日醫師楊憲勲楊憲勲以日本國鐵民營化舉例，但他認為「民營化不是萬靈丹」，強調民營化後的JR，鐵路的出軌事故也很高，原因出在軌距檢測不確實、竄改檢測紀錄。
楊憲勲表示，其實日本國鐵虧損是因為不以營利為目的，包括「福利民生的低票價」、為平衡城鄉所做的硬體建設投資，與維修所累積的債務與利息、為解決失業大量雇用退伍軍人所造成的退休金負擔等。雖然日本JR本州三社在民營化後看似轉虧為盈，但其實國鐵債務有專職單位收拾爛攤子，利用拍賣土地沖銷赤字，但地價暴跌後的債務還是由政府買單，用稅金支付。
楊憲勲認為，台鐵如果也參考日本的國鐵民營化的話，國庫會大失血，民眾繳稅金幫擦台鐵屁股；財團會在都會郊區廣設新站、炒地皮、發利市；不賺錢的海線就廢掉、南迴線交由台東縣政府自己經營；票價反應成本的調漲；賺錢的台灣高鐵，要陪嫁去幫助民營。
政治大學地政學系教授徐世榮徐世榮也持反對意見，認為「台鐵擁有龐大的土地資產，各方政客一定會在民營化之前搶食瓜分這些土地，而這其實也早已經是現在進行式了」。
徐世榮表示，「試問，台鐵如果表現優良，台灣社會會讓它民營化嗎？不會的，因此，為了達成台鐵民營化的目標，就是要讓它持續的爛下去，讓它成為眾矢之的，而不是要去拯救它，而這可能也是它不斷出事的主因。於此同時，則是要透過『鐵道局』，趕快將台鐵局最寶貴的土地資產先行取走，並轉移至當權者所聯盟的派系財團及建商手上」。
徐世榮認為，「不論是國民黨或是民進黨，台鐵民營化其實是個心照不宣的既定方向，並暗地裡持續在進行中，只是大家不明講罷了。」
基進黨立委 陳柏惟【有條件支持】基進黨立委陳柏惟
陳柏惟在臉書深入分析，時代變遷、大環境與政策下造成台鐵虧損的遠、近因，認為台鐵其實已被「砍到見骨」，強調應該先由政府推動軌道為主的都市發展導向，讓台鐵透過土地開發、都更獲利與獲得運量，否則不該要求台鐵「做這做那」。而台鐵是全台覆蓋最廣的軌道，負有城鄉平衡的公益性，要提升經營彈性，維持官股的公司化是比較可行的方式。
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（民視新聞網報導）
