新冠疫情延燒，為追蹤感染源，往往得透過「基因定序」進行解碼和比對。為解決不明感染病原追蹤不易的困境，國立中正大學著手建置「台灣病原體在地資料庫」，期望讓台灣面對下一波傳染病時，得以快速辨識感染病原。（龐清廉報導）
病原追蹤對於傳染病防治極為重要，除了分析致病、致死的病原體，還可找出相近的群聚，以及辨識新出現的變異。國立中正大學資訊工程系教授黃耀廷長年研究感染微生物基因定序，之前與台中榮總感染科合作進行抗藥菌株研究，就發現台灣有些病原體的基因序列和國外長得不太一樣，甚至發展出在地抗藥性的突變菌株，證明所有病原體都有在地化的傾向。
以這次台灣新冠肺炎疫情為例，黃耀廷教授指出，病人染疫後常因免疫力下降而被其他病原體再侵入，不僅增加治療困難度，還有難以判斷感染源的個案，突顯台灣基因定序技術雖能一次完整掃描上億個基因碎片，但最缺少的還是一個全面性的在地資料庫。
黃耀廷教授於是與亞洲準譯公司產學合作，著手建置「台灣病原體在地資料庫」。先從台灣醫院常見感染微生物基因體開始，如克雷伯氏肺炎鏈球菌、結核分支桿菌等下手，並透過與全台各大醫學中心臨床試驗逐步擴充。黃教授指出，微生物包含細菌、真菌、病毒，光是病毒株序列就有2百多萬條，資料量龐大繁雜，處理過程不只需要同時具備軟體和微生物專業知識，還得全盤瞭解感染科醫師判讀與治療準則。
「台灣病原體在地資料庫」預計1年後完成，提供醫院發展精準醫療的一個新選擇。不僅將幫助醫師即時找出重症或危險族群感染的病原體，也能追蹤台灣特有的抗藥基因，讓投藥更加精準，甚至當出現新興疾病時，還可用來比對相似的基因和可能的來源，預防疫情擴散。
