針對民進黨前主席施明德指另位前民進黨主席江鵬堅是調查局臥底，駐日代表謝長廷表示「不是事實」；媒體報導， 施明德20日受訪時則說，難道謝長廷是調查局的人嗎？他憑什麼身分知道誰是誰不是？對此，謝長廷在臉書回應說：自己不是線民，「我當然不想惹麻煩，但鵬堅兄已經過世，也不能任人羞辱，還活著的朋友有責任出來澄清，這是做人的基本、他的家屬也是這樣期待。」
謝長廷並說，他曾經跟江鵬堅是同扶輪社、同律師辦公室、擔任過他的競選總幹事，在他當主席時任社運部督導，對他的過往有一定的了解。「江鵬堅曾親口告訴我，1964年律師考試發表前有考上調查局，但他沒有去就職，在美麗島事件時，他已經是律師，不是調查局的職員，調查局如何派他去黨外臥底？這點必須謹慎求證。」
謝長廷表示，江鵬堅是民進黨建黨小組十人之一，如果他是臥底，怎麼沒有去密報？民進黨怎麼建黨成功呢？「施先生（施明德） 一貫都說民進黨建黨日期，蔣經國早就知道，一切蔣都有掌握，但蔣經國的機要室主任說，蔣是組黨當天經他通知才知道，李登輝前總統日記也明載蔣經國事先不知道。我們應該相信上面兩人的說法比較客觀不是嗎？」
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