政府強調反萊豬公投若通過，將衝擊台美關係、影響台灣加入跨太平洋夥伴全面進步協定CPTPP，有美國智庫點出台美貿易暨投資架構協定TIFA恐首當其衝。對此，經濟部長王美花今天(25日)在立法院經委回答詢時指出，公投若過對台美TIFA一定會有很不好的影響。她說：『(原音)一定會有很不好的影響，確實是會有很不好...因為TIFA就是USTR(美國貿易代表署)主導的部分，USTR對於這樣一個符合國際貿易、對於遵守這個規則的部分，USTR是美國站在第一線告訴大家，所以這個也就是為什麼，他每年公佈的貿易障礙的部分，點名台灣的，第一個一定是在講台灣的美豬的問題。』
美國智庫「德國馬歇爾基金會」亞洲計畫主任葛來儀日前指出，反萊豬公投通過將衝擊台美關係，且TIFA恐停開，甚至自貿協定或任何貿易協定都不會有進展。王美花認為，葛來儀非常了解台美關係，也對台灣非常友好。
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