2021台北上海雙城論壇落幕，受疫情、兩岸情勢影響，全程僅有一個半小時，是史上時間最短的雙城論壇。台北市長柯文哲致詞時對「兩岸一家親」隻字未提，引發各界關注，他表示，既然國內有人拿這5個字大做文章、刻意汙名化，那就乾脆不要提，或是換個方向說；至於市議員建議應向對方反應共機擾台影響台海情勢，柯文哲回應，這屬於國防範疇，應是總統職權。
今年的雙城論壇採視訊形式舉行，以「新經濟、新發展」為主題，由上海市長龔正、台北市長柯文哲先後致詞開場，並由雙方副市長、市府秘書長進行主題演講，隨後就動物園、國樂團、創新科技等3領域簽署合作備忘錄（MOU）。
柯文哲曾在2016年雙城論壇提及「兩岸一家親總比一家仇好」，引發熱議，他今日致詞時表示，「雙城論壇是兩岸最大城市之間的交流平台，也是維持兩岸關係的重要管道」，隻字未提「兩岸一家親」，他對此回應，如果國內有人要抓這5個字汙名化，那就不要講、換個方向講就好，強調基本論調還是一樣，有交流、增加善意，降低敵意。
對於台北市議員林穎孟建議，應該在雙城論壇反映、請中國大陸停止軍機擾台，但柯文哲在致詞時沒有提及，柯文哲對此回應，自己的發言時間只有3分鐘，「客套話講完，時間就到了」，他也強調，國防、外交、兩岸問題是總統職權，認為林穎孟應該向國安會、陸委會或國防部陳情才對。
