台北市長柯文哲今(4)日和台鐵簽訂「南港轉運站東站及東側商業區土地開發計畫合作意向書」，以BOT和公辦都更方式，推動南港東站及東側商業區發展，配合三鐵共構與中研院國家生技產業園區的結合，打造北部生技產業廊帶，規劃南港地區成為車站中心、生技中心、軟體中心、文創中心、會展中心等五大發展中心。
柯文哲致詞時表示，生技產業、資通訊、建築業是短期內台北市產業發展的主力，其中生技產業以南港車站作為發展中心，連結附近的中研院國家生技園區、衛福部、食藥署，未來北市衛生局也將進駐，再加上北市八家的醫學中心可以做為臨床試驗的地方，藉此形成生技園區並成為生技產業發展的基地，未來高鐵南港站開通，連結新竹將可成為台灣的生技廊帶。
柯文哲指出，南港車站是東區門戶計畫重要的交通樞紐，過去台北的交通轉運集中在單一的台北車站，未來南港東、西站啟用，配合北區轉運中心與市府轉運站，可以分散運輸負擔，此外，隨著發展而來的商業需求，像是旅館、商場、北部流行音樂中心等都會建立。
柯文哲說，未來整個南港發展的佈局，在今天簽署合作意向書之後，將大致確定，感謝鐵路局和市府一起合作，利用公辦都更和BOT的方式，將東區門戶計畫中最樞紐的南港車站東、西站的開發案完成合作意向。
會後聯訪時媒體詢問，此案已討論多時，柯文哲上任後如何化解爭議？柯文哲表示，既然合作有利，就一起合作，不用太計較就好辦，副市長林欽榮補充，過去涉及鐵路地下化及跨區市地重劃等問題，所以在土地分配上有點不清不楚，多年公文來往無進展，台鐵管理局長周永暉比較乾脆，又遇到也很乾脆的柯P，大家都不想計較太多，反正都是國家的，最後才達成共識。
