石門水庫受到颱風、豪雨從上游沖刷下來的泥沙，造成淤積嚴重，庫容減少約三分之一，經過近年不斷進行清淤等作業，最新的一次測量，庫容增加116萬立方公尺，對此，水利署表示應為測量誤差。
（李明朝報導） 石門水庫自建庫以來，集水區上游受到颱風、豪雨所帶來的泥沙，造成庫容大為減少，只要三個月不下雨，供水漸漸吃緊。
為了延長石門水庫壽命，北水局每年都會進行清淤作業，透過陸挖、抽泥，以減緩水庫的淤積，同時也規畫阿姆坪防淤隧道工程，以期淤積量、排淤量能達到平衡。
石門水庫庫容有沒有縮減或者增加，根據最近一次測量，石門水庫庫容增加116萬立方公尺，水利署副署長王藝峰表示，目前石門水庫總庫容為20,315萬立方公尺，測量是增加116萬立方公尺，但差異應該為測量上的誤差。
石門水庫最近水情良好，重新回升到高水位240公尺左右，有效蓄水率為81%。
