歷年來，我國公費流感疫苗開打日期均從10月1日起，但今年卻特別晚，衛生福利部疾病管制署公布，為了配合疫苗廠供貨時程，今年6百萬劑流感疫苗開打必須採取梯次開打，11月15日為第1梯次，對象為國小至高中學生及醫事人員；12月8日起為65歲以上長者及學齡前幼兒；109年1月1日開始為其他公費對象。
為了提高流感疫苗保護力，我國108年公費流感疫苗均從去年的3價疫苗改為4價劑型疫苗，疾管署雖已提前於今年5月完成約600萬劑4價流感疫苗的採購作業，但因藥廠供貨不及，必須延遲開打。
疾管署副署長莊人祥解釋，年初世界衛生組織（WHO）流感疫苗選株會議延遲1個月才公布北半球疫苗選株決定，以致造成全球疫苗生產、供貨時程均受影響。今年公費流感疫苗接種對象採分批接種，開打時程分別為：
第1梯次：108年11月15日起，對象為國小至高中學生及醫事人員。
第2梯次：108年12月8日起，以65歲以上長者及學齡前幼兒為主要。
第3梯次：109年1月1日起，提供其他公費接種對象。
為因應此次疫苗延遲供貨的可能影響，疾管署今年6月召開衛生福利部傳染病防治諮詢會流感防治組、預防接種組聯席會議，由於6百萬劑分批抵台，疫苗供應無法滿足全部對象，專家建議分批接種。
感染醫學會秘書長李秉穎表示，為阻斷病毒於社區傳播，降低高危險族群感染風險減少其併發重症或死亡，今年度公費流感疫苗先從高傳播族群優先接種，並依據目前廠商提供最新供貨時程及數量推估。
莊人祥強調，符合公費接種的民眾在尚未接種疫苗時，務必落實手部衛生及咳嗽禮節，保持良好個人衛生習慣，以降低感染風險，並於開打後儘速完成接種，保護自己及家人的健康。
