本土派團體台灣國大張旗鼓，到北檢按鈴控告徐正文，觸犯反滲透法。台灣國辦公室主任陳峻涵表示，「中方可能結合徐正文（包機返台），這種是叫做運送病毒的危險攻擊。」
痛批徐正文結合中方包機返台簡直在運送生化武器；尤其國台辦放話，將協助979名台灣人，三天內執飛三航班返台，知名導演楊雅喆分享貼文，質疑其中有陰謀。
貼文中痛批，這是三天內就能癱瘓全台醫療的生化恐攻，如果台灣拒絕配合中國提出的撤僑計畫，就操作輿論，造成台灣內部同情台商的仇恨分化，癱瘓台灣醫療，既可以維穩他們國內輿情，又可以對台灣造成實質的重大傷害。
而徐正文自從5日受訪過後已經神隱兩天，只有透過臉書喊冤說，病毒並不可怕，人心才可怕，說自己真的很傷心，隨即又關閉臉書，僅僅透過群組發言，階段性任務已經完成，不願再對外發言；但面對外界對他背景染紅有所質疑，連武漢班機返台都能插手調度，甚至名單如何挑選？通通沒有交代。
資深媒體人吳國棟說，「這次徐正文引起台灣人民全國的憤怒，不只是因為他的行為讓人家搞不清楚，也凸顯出兩岸很多這種政治蟑螂，不斷在這裡跑來跑去的，一點辦法都沒有。」
政治評論員李正皓也批，「另外有一個陰謀論就是說，徐正文其實這一系列都是為了要為他選中常委做鋪陳，我認為徐正文問題很大，因為他背後有太多可能，第一個他可能是對岸的傳聲筒、對岸的棋子；第二個是他為了自己要選中常委，所以故意在這邊刷聲量，故意在這邊蹭這一波所謂撤僑的熱度，把個人利益放在全國防役之前，這件事情才會讓徐正文至今變成過街老鼠真正核心問題。」
媒體人烙下重話，徐正文到底在中間扮演什麼角色？是否藉此牟利？牽扯兩岸防疫敏感神經，恐怕短時間內很難理的清。
（民視新聞／徐葳倫、林東銘 台北報導）
