為了因應新冠肺炎疫情，桃園市109年中小學校聯合運動大會取消開幕、閉幕式，同時，加強防疫措施，場地規劃單一出入口，選手一旦測得體溫偏高，再進一步確認，如確定發燒等症狀，禁止入場比賽，並協助送醫。
（李明朝報導）為了瞭解，桃園市中小學校聯合運動大會防疫措施，桃園市長鄭文燦實地瞭解，並表示為了維護選手權益，田徑及游泳賽事照常舉行，在落實防疫措施的情況下，將有效降低群聚感染的風險，也可進行環境衛生教育。
面對嚴峻的疫情，會不會增加選手心理壓力，一名參賽的楊姓選手表示，對於疫情不會造成壓力，主要是主辦單位做好萬全的防疫，本身只要專注在比賽，爭取本身的目標，希望成績能夠達標，參加後續全中運競賽。
教育局表示，這次進行田徑和游泳項目比賽，場地分別在市立田徑場及中原大學游泳池，比賽場地皆規劃單一出入口，設置機場檢疫等級的紅外線熱像儀進行初篩，體溫偏高者再由護理人員進行耳溫複測，超過攝氏38度發燒及有患病疑慮者由大會儘速協助就醫。
