珍愛藻礁公投連署確定過關，發起連署的環團被網軍連結為「中共同路人」，包括：公投護台灣聯盟促進會、制憲基金會、台灣團結聯盟、自由台灣黨等多個獨派本土社團及政黨，今（2）日除了呼籲民眾加入藻礁公投連署，也痛批，民進黨與網軍以排山倒海攻勢抹黑，讓本土社團與公民團體內部陷入嚴重分歧，建議民進黨直球對決，不要閃躲。
外省人台灣獨立促進會長許登崑強調，本土社團對維護藻礁的意志力以及立場從來沒有變過，變的是國民黨和民進黨，存在昨是今非以及昨非今是問題。對於珍愛藻礁連署遭1450網軍出征，許登崑質疑，民進黨政府長期受中國共產黨在網路散布假新聞、假消息影響，飽受其擾，照理說，對這種行徑應該深惡痛絕，竟然也用相同作法對待本土社團，讓他們很無言。
自由台灣黨主席周羅宜指出，民進黨2018年公投大輸後就得了公投恐懼症，部份民進黨政治人物誤導藻礁公投案的真正目的，一昧把所有質疑自己政策的人都打成國民黨以及中國同路人。
周羅宜喊話民進黨支持者、本土派支持者，不要再有公投恐懼症，而是面對自己當初爭取的公投權力，並呼籲民進黨直球對決公投議題，不要再閃躲，不要利用手段攻擊進步派以及參與社會運動的夥伴。
針對基督教長老教會退出藻礁公投連署，自由台灣黨主席蔡丁貴透露，據他了解，民進黨高層施壓不希望太多本土陣營表達意見，他認為這不是解決問題最好的做法，期待民進黨坦然面對。
