本土疫情也嚴重影響到南台灣觀光，墾丁民宿飯店出現大舉退房潮，外島小琉球也受波及，但島上居民更怕疫情肆虐到島上，因此已經有一百多家餐飲民宿或租車業者自主歇業，幾乎等同封島。另外，台南、嘉義各大觀光景點人潮不復見，有攤販一整天只賣出一包蝦餅。
週末假日前往小琉球的東琉線航班，乘客明顯變少，原本該是旅遊旺季的小琉球觀光，民宿客人少了一大半。民宿業者說，「退了一半，訂金的部分要處理，所以如果他沒有說他要退的話，我們還是沒有辦法，去把訂金還給他。」因為本土疫情不斷攀升，全國旅遊業受到嚴重衝擊，墾丁、小琉球出現退房潮。小琉球觀光業自主發起旅遊封島計畫，超過100家住宿、餐飲以及娛樂業者，配合串連停業，禁令到5月28日。
琉球鄉觀光協會理事長許博翰表示，「主要是封島門檻有點太高，加上當地的居民非常的多，到底是要封台灣人不來，還是當地人不出去，這會有一些疑慮。」鏡頭轉到嘉義東石，生態旅遊船班空無一人，業者一接到縣府拉高防疫層級到準三級的通知，就取消接待遊客。
觀光漁船長陳冠魁說，「從那個華航那時候開始，就開始陸續取消。」同樣受到衝擊的還有台南，小吃熱門街區國華街，遊客戴口罩逛街，人潮稀稀落落，就連安平老街，攤販大嘆，一整天只賣出一包蝦餅。儘管南臺灣的觀光景點，買氣、住房率直線下滑，業者自主歇業設下停損點，就盼熬過這波疫情。
（民視新聞／綜合報導）
