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中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中在9/30表示，願親自向台北市長柯文哲說明「3＋11」政策爭議，遭到柯文哲拒絕後，今又稱因柯位居市長，因此願意對他說明。對此，柯文哲下午受訪直指這才是有問題，不是找1、2個VIP解釋，聽得懂醫學的又不是只有柯文哲一個人。
柯文哲日前嗆「3＋11」導致新型冠狀本土疫情爆發，奪走800條人命，陳時中表示，若柯文哲到現在還弄不清楚，他願意親自溝通；柯今稍早強調，陳時中每天有全國收視率最高的記者會，有很多機會向台灣人民說明，「3＋11重點不是要說服我，是要和人民說明」。應針對疫苗政策或是防疫政策，在5/13到6月中，要說明發生什麼事情，台北市開始在回顧一條一條檢討病例。
對於中央10/5即將開放KTV等娛樂場所，柯文哲表示，北市將依照中央指示，只是當時中央在9/27發布指引時，說細則要等經濟部發布，他呼籲防疫細則趕快公布，雖然都準備好，但要看一看有多少要修一下，原則上10/5會開幕。
至於接下來開放其他場域的規畫，柯文哲說，開放也是參考其他國家的經驗，其他國家突然一下開放就大亂，後來學乖了，疫苗覆蓋率越來越高，開放程度也越來越高，所以還是保持觀察；反正不要突然一下全部開放，荷蘭、新加玻、日本好幾個例子都很慘，一步一步開放會比較安全。
