新北市深澳籍漁船新長發88號5日中午被發現在石垣島北方海域翻覆，船上的台籍船長和6名船員失聯，日方尋獲1具遺體，原以為是船上的印尼籍船員，經過相驗，確認該遺體屬於台籍船長。
5日中午12時30分，日方發現石垣島北方約150公里的釣魚台海域有漁船翻覆，連忙回報日本海上保安本部請求救援，日方確認是我國船之後立刻通報，國家搜救中心則在第一時間通報海巡署，並調派北機隊連江艦前往該海域救援。而日方尋獲1具遺體，於6日載回基隆港。
管碧玲7日下午在列席立法院總質詢前接受媒體聯訪，她證實該遺體經相驗確認為台籍船長，她也指出當時初步判斷是印尼籍船員，是因為在其身上找到印尼船員的證件，不過遺體運回台灣後驗了指紋，確認是台籍船長；目前相關後續作為都正在循程序在進行，也持續搜救當中。
