花蓮強震造成東華大學理工實驗室起火燃燒，由於現場有禁水性的化學物質，不能用水撲滅，但因為地震路毀導致外地消防車救援困難，一直到4日凌晨才完全撲滅火勢。中央災害應變中心指示教育部，後續督導加強各級學校落實校園自主防災與應變機制，並持續落實辦理。
中央災害應變中心副指揮官、內政部次長吳堂安說：『(原音)以往像一些工廠登記，我們都會有申報，所以會確實掌握，學校的部分就是有一些化學物品的掌控，這部分就請教育部督導相關各級學校，落實校園的自主防災跟應變，然後也持續來落實辦理。』
據了解，當時花蓮縣消防局向宜蘭、高雄請求化學災害處理車支援，但台九線因山壁坍崩斷裂，導致連宜蘭消防局也無法前往，而高雄消防局因路途遙遠，緩不濟急。花蓮縣消防局只能出動一般的化學消防車先行待命，等到化學物品燃燒完後才能進入火場檢視。花蓮縣消防局表示，將會和中央爭取經費，添購化學災害處理車。
0403花蓮地震中央災害應變中心4日下午舉行第五次工作會報。指揮中心也指出，4日至5日鋒面將通過，東半部及中部山區有局部短暫雨，恐易導致山崩、落石、土石流等災害風險，請相關單位務必落實雨量監控機制，如有必要儘早啟動相關應變機制，避免二次災害發生，並透過多元管道，呼籲民眾避免前往山區，並持續注意各項地震及氣象資訊，以減少受災風險。
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