近期外交部長林佳龍與國安會祕書長吳釗燮傳出不合風波，有媒體揭露林、吳內鬥細節，包括國安會的會議「把林佳龍擋在門外」等。對此，林佳龍今（13）日親自回應，他跟吳釗燮祕書長的私交很好，外交部跟國安會就是在賴清德總統督導下分工合作的關係。
林佳龍今天上午於廣播節目「POP撞新聞」接受專訪時表示，他跟吳釗燮祕書長私交很好，在公務上就是能夠分工合作。他指出，外交部跟國安會在憲政體制上有各自的角色，他是一個政治學者，有很多的實務經驗，理想中的外交部就是要去強化角色，如外館如何去落實館長制、府院除了國安會外，還有行政院經濟外交工作小組等，所以就是把制度建立，然後就事論事。
林佳龍也提到，自己和賴清德的關係就是秉持賴施政的理念、去壯大台灣的外交，外交部的角色跟功能要發揮得更好，其他部會或單位也會發揮得更好。他強調，在遇到事情時還是要回到制度面，大家都是長期很有合作的經驗，但是遇到事情時的角色分工大家要多討論。
林佳龍表示，外界有些扭曲、誤導的地方，也希望不要太過誇大，將其變成人跟人的問題，這是一個制度面，怎麼樣讓台灣的外交發揮更大，外交部跟國安會都是在總統領導之下一個分工合作的關係。
林佳龍在節目之後受訪時進一步說明，他跟吳釗燮的工作雖有時會互相調換，就像他在國安會服務過、現在擔任外交部長，吳釗燮也一樣，他們在總統府也都擔任過祕書長、副祕書長，所以他們是很熟識的朋友。在公務上，國安會跟外交部也是一個團隊，所以就做好分工合作。
林佳龍強調，他們是一個簡訊就可以溝通，而且在群組也幾乎隨時一起在打仗。他表示，外界有一些扭曲錯誤的報導，外交部跟國安會也都做了澄清，所以請大家不要再去擴散，這對台灣的外交上也會有傷害，國際上會以為是人事的問題。
林佳龍指出，事實上是制度面怎麼樣來強化國安跟外交團隊做好分工，他們也會在持續的合作中達成捍衛台灣國家的利益。他表示，以結果論來講，在賴總統主政這一年半的時間，在外交工作上是有很多的發展，這也是國安團隊一起促成的。
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