歐洲國家幾乎袖手旁觀的態度以及大量難民湧入超出負擔，德國於13日宣布將重新實施境管，德國內政部長梅奇爾指稱（Thomas de Maiziere），德國願意幫助難民，但重申全歐洲都應該公平分攤，尤其部分國家不遵守難民首先到達的國家必須為難民登記的規定，因此決定恢復臨時邊界管制。眼看這波難民潮已經使《申根公約》面臨20年來最大危機，歐盟也決定14日召開緊急會議商討難民問題。
成千上萬的難民湧入歐洲，已經使得歐洲各國難以負擔，更引發歐盟國家之間的齟齬，最願意接納難民的德國，因湧入太多的難民，光慕尼黑在兩週內便擠進6.3萬名難民，讓德國政府負擔達到極限。
據《BBC》報導指出，德國內政部長德梅奇爾（Thomas de Maizière）13日召開記者會宣布啟動邊境管制。梅奇爾更強調：「德國已經表達願意幫助難民的意願，但這個意願不該被拖垮，全歐洲都應該公平分攤。」他還向其他鄰近國家喊話，要求歐盟成員國必須遵守難民在第一入境國就必給予避難登記的條例規定，因為過去這段時間，有些國家已經不遵守這項規定。
據報導，德國這次的境管重點為德國和奧地利邊境地區，儘管德國表示這項境管為臨時措施，但卻讓鄰近國家對管制難民進入更有理由。目前德國和奧地利之間的鐵路交通已經停止，而難民另一個通往德國的捷徑為捷克，當地政府也決定將加強捷克與奧地利邊界管制，深陷難民潮的匈牙利則在與塞爾維亞邊境加強更多防護措施。
《路透社》也指稱，這場「難民危機」已經讓實施多年的《申根公約》面臨前所未有的挑戰，根據公約規定，申根公約國彼此是不進行邊境管制的，且外國人只要持有其中一國的簽證便可在所有公約國之間自由來去。德國正是簽署國家之一，並於1990年代已經對歐洲申根國家取消檢查護照等邊境管制，而開放的邊境政策，正是《申根公約》的重要精神所在。
按現行的《申根公約》規定，各國可以在處理緊急狀況下，與其他申根國家商討，暫時執行邊境管制。德國在稍早發出境管聲明時便強調，正因為歐盟已完全無法控管邊境。德國需要設法自己控制自己的邊界。
為了解決難民分配的問題，歐盟國家代表已經於當地時間週日（13日）晚間討論難民問題，但仍未能打破僵局，部分東歐國家仍拒絕接受攤派的難民接收配額，理由是他們認為該方案會吸引更多難民湧入歐洲，但在德國宣布境管後，歐盟各國內政部長將於當地時間14日在布魯塞爾就難民危機召開特別會議，歐盟更在會前疾呼各國必須儘速達成難民分配安置計畫。
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