耗費200多億工程經費，曾受地方環保團體強烈反對，甚至還有地方人士當年因主打反對湖山興建而當選民代，雲林縣湖山水庫今（2）日正式蓄水。儘管總統馬英九形容水庫「好事多磨」，然而有地方人士憂心，與集集攔河堰串聯調節供水、主要以供應中區工業區用水的湖山啟用，將使得濁水溪下游的沙塵暴更加嚴重。
國小校長陳清圳透過臉書發文更直言，「八色鳥在水庫區，當初環評承諾的復育，經過調查，沒有半隻」。
「依照湖山水庫的環評報告及水保法水庫上游不能有任何觀光活動，希望能夠依照承諾完成。否則會有法律問題」。
雲林縣湖山水庫今天下閘蓄水，總統馬英九、行政院長張善政下午視察湖山水庫，主持下閘（導水隧道封堵）蓄水儀式，包括雲林縣副縣長張皇珍、雲林縣議會議長沈宗隆，立委張麗善，經濟部、水利署等各界都與會。
湖山水庫從民國68年開始規劃，90年核定，期間曾為了八色鳥生態及文化遺址調查，延期3次，馬英九形容湖山水庫是「好事多磨」，可期為雲林地區帶來優質及穩定供水，並減緩地層下陷。
馬英九也盛稱讚湖山水庫重視生態保育、環境優美，適合規劃跑步或自行車比賽，發展「雲林後花園」觀光，在便利和充沛供水之餘，也發揮減緩地層下陷的功效。
經濟部水利署長王瑞德指出，湖山水庫歷經4名水利署長、9名中區水資源局長，獲得大壩工程特優等5項金質獎，國內首件施工期間兼顧生態保育工程，壩長1521公尺國內最長，首座大壩基礎採用塑性混凝土截水牆。
王瑞德表示，湖山水庫蓄水量5218萬立方公尺，將分三階段蓄水，每階段完成檢查評估通過才進行下一階段，到滿水位標高211.5公尺需時1年至1年半，預計今年7月營運階段性供水。
儘管風光完工啟用蓄水，但直到昨天，湖山水庫仍有37萬立方公尺剩餘土方，堆置在進水口附 近（見上圖），民進黨立委劉建國1日下午邀經濟部官員現勘，質疑強蓄水恐危水庫安全與壽命。部分地方人士相當憂心湖山水庫帶來的生態安全危機，就在風光蓄水的今晚，國小校長陳清圳晚間在臉書發文反對湖山水庫。
「針對湖山水庫一案，大家關注的蓄水情形。雖然記者問我，其實我一直不想碰觸的議題，因為知道太多，情感一直無法釋懷。但想一想，還是做個歷史見證，我不管大家對我的評價如何，我至始至終堅持反對興建的立場，儘管已經蓄水，我還是反對。」
他敘述反對的理由如下：
一、 湖山水庫不是為解決民生用水而建的水庫，他就是要供應中區不斷增建的工業區使用，當初去拜會一位中央單位主管，他也明確表示。(註：湖山水庫與集集攔河堰聯合使用，當湖山水庫提供民生用水時，集集攔河堰就可調撥給工業用水。若是要提供給民生用水，應該興建集集攔河堰的淨水廠，而不是水庫，況且雲林人口沒增加，為何要增建水庫？)
二、 湖山水庫不是為解決地層下陷而建的水庫，地下水需要補充和有條件抽用，目前集集攔河堰加上湖山水庫的桶頭堰二條把所有水源全取用，請問位在林內屋突的地下水補充區，怎有水補充到地下第二層、第三層的含水區。
三、 湖山水庫使用後，濁水溪下游的沙塵會更嚴重，原先還有清水溪的水往下流，目前全截流，想就知道。
四、 湖山水庫的淤積會比預期嚴重。位在桶頭攔河堰上游的清水溪，九二一以後蓄積一億七千萬噸的土砂，八八風災後，增加到三億噸以上，這些評估需要二十年以上的時間才能平衡，清水溪自從災變以後，沒有一天清過。一個桶頭小小的沉沙池，無法沉澱這麼大量的泥沙，在需水孔求下，本來可以使用百年的離槽水庫，預估二三十年就要清淤。
五、 湖山水庫花了204億。難道沒有其他方案可以取代？當然有。而且對環境會更友善，花費更少，只是開發單位聽不進去，時隔多年，這些替代措施在台灣各地也都逐步在推動。但不該為漫無節制的開發供應水源。
六、八色鳥在水庫區，當初環評承諾的復育，經過調查，沒有半隻。因為人為不可能復育一個八色鳥(含其他物種)的生態環境。所以以後任何開發案，不要再提類似的生態補償措施，那是不太可能做到的。
七、 文化史蹟遺址，這也是環評承諾，先不提遺址，光挖到台灣第一筆猛瑪象頭骨，就夠台灣震撼的。怎麼保密到家，不是依法必須停工招開專家會議？猛瑪象頭骨目前存放科博館。
八、 斷層效應，當初依照現有資料有增強結構體。但近來九芎坑斷層的確認，他所引發的連鎖效應，需要再確認。
八、 斷層效應，當初依照現有資料有增強結構體。但近來九芎坑斷層的確認，他所引發的連鎖效應，需要再確認。
九、 依照湖山水庫的環評報告及水保法水庫上游不能有任何觀光活動，希望能夠依照承諾完成。否則會有法律問題。
陳清圳最後呼籲，「我知道台灣大多數人都有大壩水庫的迷思，但台灣的特質是不適合建水庫的，水庫一建成，就開始走向死亡之路，台灣有很多永續的取水方案。從國際趨勢，多元取水方案才是未來的主流。因為一個山區水庫就等於是環境的毀滅，台灣必須善待我們這塊土地，才對得起未來子孫」。
