傳統穀飼方式所得的乳製品與草飼所得的生乳製品（尤其是全脂和培養或發酵的）兩者的營養價值差異非常大。
草飼的乳品－－尤其是其中的脂肪，是脂溶性維生素和共軛亞麻油酸的最佳來源，共軛亞麻油酸是一種抗發炎並有修復效果的脂肪；發酵乳製品是益生菌的最佳來源；乳製品中還包括了部分重要的蛋白質，例如穀胱甘肽和乳清蛋白。
然而，就算是高品質的乳製品，營養密度仍舊不如高品質的肉類、海鮮、蔬菜和水果，而且再高品質的乳製品，還是可能對患有自體免疫疾病的人帶來潛在的嚴重問題，所以對乳製品應有攝取限制（至少在飲食計畫之初），原因如下：
＊牛乳中含有蛋白酶抑制劑，可能會引起腸漏症的發生（而腸漏症是自體免疫疾病的共通指標之一）。
＊牛乳會高度刺激胰島素分泌，可能導致發炎反應和胰島素抗性。
＊乳蛋白非常不好消化，而且是大腸桿菌偏好的食物，這可能會導致腸道生態失衡。
＊牛乳中含有具活性的牛賀爾蒙，有改變人體內激素水平的潛在可能。
＊牛乳會使黏液分泌增加，這可能會令氣喘這一類的情況惡化，也會在消化道中製造過多黏液，造成腸道內壁的敏感，並且妨礙營養素和礦物質的吸收。
＊有很多成年人無法耐受乳糖。
＊乳製品有高度致敏性。
＊麩質不耐的人可能在生成拮抗麩質的同時也會辨識乳蛋白的抗體，對這些人來說，食用乳製品和食用麩質的影響是相同的。
－－整理自《恐怖的自體免疫疾病療癒聖經》，更多精采介紹請按此
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