台北市長柯文哲7日接受專訪時，指日前去環南市場視察時，遭中央疫情指揮中心「設局」開記者會。對此，衛福部次長薛瑞元今天(8日)回應表示，柯文哲的說法有損他高智商的形象，當天記者會有通知台北市副市長黃珊珊，且柯文哲比指揮中心指揮官陳時中還要早到達現場。
台北市長柯文哲在接受網路節目專訪時表示，中央日前到環南市場視察，當時告訴他是去開會，結果他到了現場才知道有有聯合記者會；柯文哲砲轟中央「設局」。
對此，衛福部次長薛瑞元8日在行政院會後記者會表示，柯文哲的說法有損他高智商的形象。薛瑞元指出，在環南市場爆發感染前，中央便已透過大數據分析和疫調判斷環南市場有群聚現象，需要積極介入，當天記者會有通知台北市副市長黃珊珊，且柯文哲比指揮中心指揮官陳時中還要早到。他說：『(原音)指揮中心就決定必須要介入，成立前進指揮所，這個前進指揮所是會跟北市府一起成立的，所以事前指揮官親自打電話通知台北市副市長，柯市長也知道，所以當天到環南市場，事實上柯市長是比指揮官還早在場。』
柯文哲專訪時也批評政府拒絕採購BNT疫苗是因為意識形態，政務委員、行政院發言人羅秉成回應，政府對疫苗的態度始終不變，就是對外積極採購、國內同步研發，只要疫苗合法、安全、有效，政府都樂於採購，外界不用多做揣測。
針對柯文哲批評疫苗預約系統上線太慢，且沒有告訴他疫苗預約平台的事情。政務委員唐鳳也回應，6月的工作會議曾邀集地方政府資訊單位同仁出席，包括6月10日、17日和25日的會議，地方政府都有收到邀請，台北市則出席了其中2場。唐鳳表示，她在7月4日也曾當面告訴柯文哲關於疫苗預約系統一事，柯文哲當時表示應該要早點上線，唐鳳則說各縣市75歲以上民眾的狀態不同。
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